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诚信经营质量保障价格合理服务贴心在常规细胞系中已经做通CRISPR实验,并不意味着换成原代细胞以后同样可以顺利复制。
很多研究人员第一次进行原代细胞CRISPR Cas9电转时都会发现一个明显变化:
参数变得更加“敏感"了。
稍微温和一些,编辑效率不够;稍微加强一点,细胞活率又快速下降。
这并不罕见。
相较于部分长期培养、适应性较强的细胞系,原代细胞通常对外界刺激更加敏感,可接受的电转条件窗口也可能更窄。
随着基因功能研究、疾病模型、细胞治疗以及精准医学研究不断深入,很多项目已经不满足于只在常规细胞系中验证结果。
研究人员希望进一步观察基因编辑在更接近真实生物学环境的细胞中的表现。
这时候,原代细胞、免疫细胞、干细胞等样本的重要性就会明显提高。
但同时,一个实际问题也出现了:
很多传统化学转染方法在部分难转染细胞中的效率有限。
电穿孔因此成为CRISPR递送中常见的技术路线之一。
通过短时间电脉冲改变细胞膜通透性,可以将Cas9相关编辑组分导入细胞内部。
但“能够电转"和“能够稳定做好CRISPR电转",并不是一回事。
首先是样本本身更加敏感。
原代细胞在分离、培养、消化和转移过程中已经可能经历一定应激,再叠加电转刺激,就更容易出现活率下降。
其次,不同来源样本之间可能存在差异。
例如不同供体、不同批次,甚至不同分离时间,都可能改变电转表现。
这也解释了为什么有些实验室会遇到这样的问题:
相同的CRISPR Cas9电转参数,上一次实验效果很好,下一批样本却突然变差。
这种情况下,不能只怀疑sgRNA或者Cas9,也需要检查细胞本身是否发生了变化。
对于容易操作的细胞,可以接受的参数范围可能比较宽。
但对于敏感的原代细胞,可用参数往往集中在一个相对狭窄的范围。
这时候设备的调节能力和输出稳定性就比较重要。
如果参数调整跨度太大,就可能出现一个条件导入不足,而下一个条件细胞损伤已经明显增加的情况。
因此,在建立原代细胞CRISPR Cas9电转方案时,可以先通过较宽范围找到大致方向,再对有效区间进行进一步细化。
优化目标也不要只设置成“编辑效率高"。
对于原代细胞而言,细胞活率和后续功能状态往往同样重要。
客户在选择CRISPR电转方案时,经常容易忽略一个现实问题:
你做基因编辑的目的是什么?
如果只是验证一次基因是否被敲除,那么关注编辑效率可能已经足够。
但如果后面还需要做表型研究、功能检测、细胞扩增或者下游应用,那么电转之后细胞是否保持健康状态,就会直接影响整个项目。
所以在评价原代细胞CRISPR Cas9电转效果时,可以同时关注:
编辑效率;
细胞活率;
细胞恢复状态;
增殖能力;
必要情况下的功能指标。
只有这些结果能够同时满足研究需求,这套参数才真正具有应用价值。
原代细胞本身已经存在较多生物学差异,如果设备输出再不稳定,就会进一步增加实验的不确定性。
这也是实验室选择CRISPR电转设备时需要考虑重复性的原因。
开云网页版登录入口V-leader电穿孔平台面向细胞转染、CRISPR基因编辑及多类型样本电转应用,可通过不同脉冲条件进行参数优化。对于原代细胞等敏感样本,建议依据实际细胞状态进行分组预实验,逐渐建立适合本实验室的参数窗口。
对原代细胞CRISPR Cas9电转来说,真正重要的不是找到别人所谓的“最佳参数",而是找到自己样本能够稳定复现的参数。
因为当实验从普通细胞系进入原代细胞以后,决定结果的往往不再是某一个单独变量,而是细胞、编辑体系、电转条件和恢复过程共同形成的一整套实验流程。