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诚信经营质量保障价格合理服务贴心很多实验人员第一次做原代细胞电转时,都会先去查文献。
找到相似的细胞类型之后,把论文中的电压、脉冲时间和其他条件记录下来,然后按照文献参数直接进行实验。
这种方法当然可以作为起点,但一个经常出现的问题是:
文献里能够成功的原代细胞电转条件,到了自己的实验室却并不一定能够得到相同结果。
这并不奇怪。
因为原代细胞实验涉及的变量远比表面看到的几个电学参数复杂。
即使细胞名称一样,也可能存在很多不同。
细胞来源不同、分离方式不同、培养状态不同、供体不同、试剂体系不同、电转杯不同甚至实验室操作习惯不同,都可能影响最终结果。
更重要的是,不同实验使用的电转设备输出方式也可能存在差异。
所以只看到文章中写着一个电压数字,并不能说明把同样数字输入另一台设备就一定能够获得相同效果。
正确思路应该是:
把公开文献条件作为起始参考,再结合自己的样本建立参数窗口。
原代细胞电转参数优化之前,首先要明确递送物形式。
质粒DNA、mRNA、siRNA以及CRISPR/Cas9 RNP的实验需求并不相同。
例如,如果实验目标从质粒表达改成RNP编辑,即使细胞类型没有变化,也不应该简单认为过去的参数可以直接复制。
因为不同分子在细胞内发挥作用的位置、稳定性以及需要达到的有效递送量并不一致。
这也是为什么同一个实验室做不同项目时,往往需要重新进行一定程度的参数验证。
同样是原代细胞,有些类型相对容易操作,有些则对外界刺激十分敏感。
尤其是原代免疫细胞、部分干细胞以及刚完成组织分离的细胞,在参数优化阶段更应该关注活率。
如果一开始直接采用非常强的条件,很可能还没有找到有效参数,就已经造成大量样本损失。
对于珍贵的临床样本或动物来源样本来说,这种试错成本尤其高。
因此,实际工作中通常更适合围绕一个合理起始条件建立梯度,而不是进行没有方向的大范围尝试。
原代细胞电转最怕的并不是失败,而是“失败之后不知道为什么失败"。
因此实验设计应该尽量让每轮实验能够提供信息。
例如第一轮主要确定脉冲强度大致范围;
第二轮在相对合适的区域中进一步调整脉冲持续时间;
第三轮再结合脉冲次数、递送物用量以及其他实验条件继续优化。
这样每做一轮实验,都能进一步缩小参数范围。
如果一次把所有参数都改变,即使出现理想结果,也难以判断哪些因素真正重要,后续实验的重复性自然也难以保证。
原代细胞电转优化过程中,不建议只记录转染率。
至少应该同时记录细胞活率。
更加完整的项目还可以根据实验目的增加后续表达、编辑效率或者功能性指标。
通过这种方式,可以把不同参数组合进行横向比较。
有时候会发现,某一组参数的效率虽然最高,但综合结果并不是最好;另一组参数的效率略低,却能够保留更多健康细胞。
对于需要进一步培养和实验的原代细胞来说,后者往往更有实际意义。
很多人做到一次理想结果就结束参数优化,这也是一个常见问题。
原代细胞本身存在批次差异,因此一次成功并不代表条件已经真正建立。
参数确定之后,最好结合不同批次样本进一步验证。
如果不同批次都能维持相对稳定的结果,才说明这组条件具有更好的实际应用价值。
如果波动非常明显,则还需要判断究竟来自细胞个体差异、样本前处理,还是设备输出和实验操作。
对于原代细胞研究来说,设备不应该只提供一个“能够放电"的功能。
真正影响实验体验的是:
参数范围是否覆盖实验需求;
脉冲宽度是否可以灵活调整;
参数控制是否足够细;
相同程序重复运行时输出是否稳定;
不同细胞实验是否方便建立和保存程序。
尤其实验室同时进行原代细胞、免疫细胞、干细胞或者CRISPR递送项目时,设备的参数灵活性会直接影响后续实验扩展能力。
原代细胞电转没有一个适用于所有实验室的“万能参数"。
真正有价值的方法,是建立一套自己的优化逻辑。
先确定递送对象,再判断细胞特点,然后逐步调整电学条件,最终通过效率、活率和重复性共同筛选参数。
当参数优化从“不断试数字"变成一套有逻辑的实验过程之后,原代细胞电转的试错成本往往能够明显降低。